Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN16Q9UKR8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms