Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 921.3 ms