Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSRAQ9UJ68 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSRAQ9UJ68 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms