Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPHA6Q9UF33 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA6Q9UF33 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA6Q9UF33 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA6Q9UF33 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA6Q9UF33 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA6Q9UF33 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA6Q9UF33 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA6Q9UF33 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA6Q9UF33 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms