Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.345e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-211ENST00000442148 759 ntTSL 523.39■■□□□ 1.335e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.195e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.15e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.975e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SCAMP4-204ENST00000414057 1477 ntTSL 1 (best)20.45■□□□□ 0.865e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.855e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SCAMP4-211ENST00000588907 547 ntTSL 420.36■□□□□ 0.855e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SCAMP4-203ENST00000411971 783 ntTSL 520.3■□□□□ 0.845e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SFT2D1-202ENST00000478705 659 ntTSL 220.25■□□□□ 0.835e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.785e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 NEK7-205ENST00000442588 519 ntTSL 519.84■□□□□ 0.775e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.755e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.745e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.745e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SCAMP4-205ENST00000452128 718 ntTSL 219.63■□□□□ 0.735e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.615e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.575e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.445e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.445e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.445e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.435e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.415e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-220ENST00000532233 543 ntTSL 417.55■□□□□ 0.45e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-217ENST00000526722 585 ntTSL 417.25■□□□□ 0.355e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-218ENST00000528491 507 ntTSL 417.25■□□□□ 0.355e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-207ENST00000420266 784 ntTSL 516.91■□□□□ 0.35e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 DNM2-218ENST00000591701 863 ntTSL 316.74■□□□□ 0.275e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SCAMP4-206ENST00000460767 569 ntTSL 416.5■□□□□ 0.235e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.125e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.085e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.035e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SFT2D1-204ENST00000487841 2576 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.045e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 513.65□□□□□ -0.225e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 SCAMP4-208ENST00000489554 573 ntTSL 312.8□□□□□ -0.365e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 TGFBR1-209ENST00000552516 5933 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.45e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 ZMYM4-202ENST00000441447 466 ntTSL 511.85□□□□□ -0.515e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.135e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.435e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-208ENST00000424454 1330 ntTSL 26.02□□□□□ -1.455e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 TGFBR1-204ENST00000547314 533 ntTSL 44.66□□□□□ -1.665e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 WAC-219ENST00000530865 468 ntTSL 24.31□□□□□ -1.725e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 TGFBR1-210ENST00000552573 526 ntTSL 40.9□□□□□ -2.275e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 RPL4-211ENST00000566491 593 ntTSL 215.2■□□□□ 0.023e-50■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 LDB1-204ENST00000490751 762 ntTSL 238.34■■■■□ 3.734e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.584e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.784e-6■■□□□ 11.7
AATFQ9NY61 PUM1-221ENST00000530669 582 ntTSL 312.42□□□□□ -0.423e-6■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.922e-80■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-80■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 TAF1D-204ENST00000525928 1710 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-80■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 TAF1D-222ENST00000546088 1728 ntTSL 37.81□□□□□ -1.162e-80■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 TAF1D-210ENST00000529435 1011 ntTSL 56.57□□□□□ -1.362e-80■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 TAF1D-215ENST00000530769 4358 ntTSL 25.76□□□□□ -1.492e-80■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 TAF1D-202ENST00000393259 547 ntTSL 33.36□□□□□ -1.872e-80■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 TAF1D-221ENST00000540232 483 ntTSL 32.4□□□□□ -2.032e-80■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)16.54■□□□□ 0.245e-6■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 515.64■□□□□ 0.095e-6■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.825e-6■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.935e-6■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.332e-57■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 SNHG25-201ENST00000580828 106 ntTSL 214.81□□□□□ -0.042e-57■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 HNRNPH1-221ENST00000513230 248 ntTSL 327.32■■□□□ 1.965e-7■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 HNRNPH1-242ENST00000522256 492 ntTSL 418.69■□□□□ 0.585e-7■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 HNRNPH1-226ENST00000515446 368 ntTSL 218.63■□□□□ 0.575e-7■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-207ENST00000577410 873 ntTSL 529.66■■■□□ 2.343e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.643e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.623e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-216ENST00000581202 1013 ntTSL 524■■□□□ 1.433e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.13e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-217ENST00000581743 785 ntTSL 520.59■□□□□ 0.893e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 520.24■□□□□ 0.833e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-218ENST00000581795 1430 ntTSL 220.21■□□□□ 0.833e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.793e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-208ENST00000577432 866 ntTSL 519.56■□□□□ 0.723e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-210ENST00000578082 841 ntTSL 417.48■□□□□ 0.393e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 517.25■□□□□ 0.353e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.13e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 NARF-209ENST00000577812 2598 ntTSL 513.34□□□□□ -0.273e-11■■□□□ 11.6
AATFQ9NY61 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.334e-81■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 SPRED2-205ENST00000440972 555 ntTSL 315.77■□□□□ 0.125e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.095e-6■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 EIF4G1-232ENST00000466311 573 ntTSL 218.16■□□□□ 0.51e-74■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 EIF4G1-225ENST00000448284 677 ntTSL 516.36■□□□□ 0.211e-74■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 529.51■■■□□ 2.312e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.462e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 315.9■□□□□ 0.142e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -02e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-217ENST00000549988 544 ntTSL 314.77□□□□□ -0.052e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.242e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-215ENST00000549479 573 ntTSL 213.07□□□□□ -0.322e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.422e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 512.21□□□□□ -0.452e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 512.21□□□□□ -0.452e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 511.87□□□□□ -0.512e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-15■■□□□ 11.5
AATFQ9NY61 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.542e-15■■□□□ 11.5
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