Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MED9Q9NWA0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED9Q9NWA0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms