Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD4Q9NVD3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD4Q9NVD3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms