Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNTG1Q9NSN8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms