Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT82Q9NSB4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT82Q9NSB4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms