Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM7SF3Q9NS93 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms