Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TULP4Q9NRJ4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms