Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCL28Q9NRJ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms