Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BATF3Q9NR55 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BATF3Q9NR55 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms