Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN4Q9NQC3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms