Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNPLA8Q9NP80 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNPLA8Q9NP80 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms