Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPB41L5Q9HCM4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41L5Q9HCM4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms