Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC134Q9H6E4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC134Q9H6E4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms