Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Z4

NKX2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-4Q9H2Z4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX2-4Q9H2Z4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-4Q9H2Z4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms