Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH6AQ9H0K4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms