Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNHG12Q9BXW3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNHG12Q9BXW3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms