Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BBS2Q9BXC9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BBS2Q9BXC9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms