Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms