Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PBDC1Q9BVG4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms