Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSG1Q9BU20 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms