Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCMBPQ9BTE3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms