Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRACR2AQ9BSW2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRACR2AQ9BSW2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms