Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX50Q9BQ39 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX50Q9BQ39 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms