Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms