Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP88Q99567 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms