Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAT1Q99536 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms