Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYCBPQ99417 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYCBPQ99417 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms