Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HHIPQ96QV1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms