Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms