Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM47Q96LD4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM47Q96LD4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms