Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms