Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDLIM2Q96JY6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDLIM2Q96JY6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms