Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC22AQ96IW7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms