Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SHDQ96IW2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHDQ96IW2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms