Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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RNF185Q96GF1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF185Q96GF1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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