Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHFRQ96EP1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHFRQ96EP1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHFRQ96EP1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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