Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPCDCQ96CD2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPCDCQ96CD2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPCDCQ96CD2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPCDCQ96CD2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPCDCQ96CD2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPCDCQ96CD2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPCDCQ96CD2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPCDCQ96CD2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPCDCQ96CD2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms