Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKL1Q969V6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms