Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1MTQ969P6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1MTQ969P6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms