Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCD2Q92925 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms