Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNKSR2Q8WXI2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNKSR2Q8WXI2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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