Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms