Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms