Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BBOF1Q8ND07 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms