Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRACR2BQ8N4Y2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms