Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STAG2Q8N3U4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms